Postdoktor inom single-cell cancer multiomics och/eller datavetenskap (1-2 positioner)

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Din roll

Forskningsgrupp

Anslut dig till oss vid institutionen för Onkologi-Patologi, Karolinska Institutet. Forskningsgruppen under ledning av Martin Enge är specialiserad på metod-driven forskning på patientmaterial, särskilt inom området single-cell multiomik. Vi är en tvärvetenskaplig grupp med expertis inom både torr- och våtlaboratoriemetoder. Vi kombinerar banbrytande grundforskning med starka band till kliniken och strävar efter att direkt påverka framtida klinisk praxis.

Projektbeskrivning

Friska vävnader utgörs av ett begränsat antal distinkta celltyper och celldifferentiering är strikt reglerat. Cancerceller har emellertid genetiska förändringar som tar bort sådana begränsningar, vilket betyder att olika kloner i samma individ kan ge upphov till sinsemellan olika celltyper som är unika för det muterade genomet. För att förstå hur subklonal variation påverkar celltyper i cancer har vi utvecklat en uppsättning single-cell multiomik-metoder, bland annat DNTR-seq för parallel WGS/mRNA-seq (se: Zachariadis et al. Mol. Cell 2020, Andrews et al. Nat. Methods 2021, Enge et al. Cell 2017). I detta projekt använder vi dessa metoder metoderna för att studera klonal heterogenitet i leukemier och solida tumörer och förstå hur kopienummer påverkar genuttryck. Vi arbetar också med en longitudinell studie under induktionsbehandling för att bättre förstå genetiska och epigenetiska egenskaper hos de celler som undkommer behandling för att sedan ge relaps.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Vi letar efter 1-2 drivna forskare med ett intresse av att studera cancer genetik/genomik med hjälp av nydanande singel-cell metoder. Du bör redan ha en stark vetenskaplig bakgrund, inklusive högt meriterande vetenskapliga publikationer, och självständigt kunna driva vetenskapliga projekt. Våra projekt är tvärvetenskapliga, och du bör vara intresserad av att lära dig både molekylärbiologi och datavetenskapliga metoder. Vi förlitar oss mycket på samarbeten med kliniker, vilket du förväntas hantera. Kompetens i skriftlig och muntlig engelska är nödvändig.

Vi söker primärt kandidater med följande profiler:

1. En bioinformatisk forskare med intresse för cancergenetik. Den ideala kandidaten har en stark bakgrund inom datavetenskap/computational biology. Specifik erfarenhet av att analysera sekvensnivådata på singel-cellnivå, R/Bioconductor och Python/Tensorflow/PyTorch är en merit men är inte ett krav.
2. En experimentell forskare med intresse för metodologiskt driven cancerforskning. Starka meriter som inom molekylärbiologiska metoder är ett krav. Specifik erfarenhet av cancergenetik eller single-cell genomik är en merit men är inte ett krav.

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Solna

 Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Varmt välkommen med din ansökan senast den 27 maj. 

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.  

Anställningen är 2 år med möjlighet till förlängning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss

1. Martin Enge, martin.enge@ki.se

1. Helen Eriksson, OFR, helen.eriksson@ki.se
2. Henry Wölling, Seko, henry.wolling@ki.se
3. Per Hydbring/Nick Tobin, SACO, per.hydbring@ki.se/nick.tobin@ki.se